AsianScientist（2026年4月09日）——活禽市场在亚洲很常见，但却是传染病传播的高风险环境。由于人与禽类密切接触，禽流感和冠状病毒等病毒很容易在禽类之间传播或传染给人类，因此监测疾病以预防疫情爆发至关重要。
目前活禽市场病毒检测方法是对随机抽取的禽类进行咽喉和消化道拭子采样，这一过程耗时费力，且对工作人员构成生物安全风险。此外，如果抽检的禽类在检测时并未感染病毒，则该方法可能无法检出病毒。
杜克-新加坡国立大学医学院的研究人员发现，环境监测可能是检测活禽市场中更广泛病毒的可行方法。
“我们证明，在活禽市场检测致病病毒时，并不总是需要直接进行动物试验，”论文第一作者、杜克-新加坡国立大学新兴传染病重点研究项目的研究员彼得·克罗宁说。
研究团队从柬埔寨的两个活禽市场采集了样本，包括空气、笼具表面、饮用水和胴体清洗用水。随后，他们对这些样本进行了宏基因组分析，以从其遗传物质中识别环境中存在的病毒。
将结果与在相同地点和时间采集的传统鸟类拭子样本进行了比较。
虽然捕获的病毒数量没有显著差异，但环境采样检测到病毒的传播总体上更加多样化，其中空气样本显示出捕获的病毒种类多样性最高。
重要的是，环境监测能够捕获一些逃脱传统拭子检测的病毒，包括 H5N1，这是一种禽流感 A 病毒，对人类的致死率高达 50%。
“这项研究比单独进行单只动物测试更全面地展现了活禽市场中病毒的传播情况，”共同资深作者、新兴传染病重点研究项目主任加文·史密斯教授说。
环境监测不能完全取代传统的鸟类拭子检测方法，因为与环境采样相比，某些病毒更容易通过直接拭子检测出来。
研究人员建议，提高病毒检出率的最佳策略是将环境采样与家禽取样相结合。这既能最大限度地降低工作人员的生物安全风险，又能全面了解活禽市场环境中存在的病毒。
史密斯说：“通过对环境样本进行无偏宏基因组测序，我们可以捕获在共享空气和表面上散落的病毒物质，从而以经济高效且可扩展的方式进行更广泛的检测，同时减少与动物密切接触的需要。”
环境监测还可以帮助制定有针对性的风险缓解策略。例如，空气样本中病毒载量高表明需要改善通风。
“这些研究结果表明，通过更高效、更安全的方法，可以加强对高风险人畜接触界面的监测。提高早期发现率最终有助于加强疫情防控，”杜克-新加坡国立大学医学院临时副院长（研究）洛克·希梅教授表示。
该团队目前正在将环境监测研究拓展到其他场所，例如猪屠宰场和野生动物栖息地。一旦完善，这种方法有望成为早期发现疫情的有效实用工具。
-
来源: 杜克 - 新加坡国立大学医学院;图片来源：SomboonKaeoboonsong/Freepik
本文可以在以下网址找到： 环境宏基因组学增强了柬埔寨活禽市场中循环病毒的检测能力
免责声明：本文并不一定反映亚洲科学家或其工作人员的观点。